La Reserva de la Biosfera de Calakmul es el bosque tropical protegido más grande de México, cubre un área de 723,185 héctares, fue declarado reserva de la biosfera por el UNESCO en 1989.

La Reserva se encuentra entre los 260 y los 385 msnm. El clima es cálido, con oscilaciones térmicas anuales reducidas, y con lluvia en torno a los 750 mm. Es una región de rocas calizas jóvenes, con bastante importancia del relieve kárstico. Su topografía es básicamente llana, con valles y vaguadas cársticas donde el terreno se inunda en ciertas temporadas, el terreno es muy permeable. Aunque también hay algunas zonas de acumulación permanente de agua. La escasez de las aguadas, les da un valor ecológico grande.

Calakmul es una región de selva tropical que cuenta con una alta diversidad biológica. Se han censado 358 especies de aves, 18 de anfibios, 75 de reptiles, unas 380 de mariposas, 31 de peces y 86 de mamíferos entre las que destaca el jaguar que cuenta aquí con una de las mayores poblaciones de Centroamérica.

En cuanto a la flora de la región, se han contabilizado unas 1500 especies de plantas, siendo un 10% endémicas de la zona.? Se encuentran muchas especies con interés económico como la caoba o el chico zapote. La geografía de la región crea pequeñas vaguadas inundables, llamadas akalché en las que surgen otros tipos de plantas como el camalote, los nopales, o el chucum. Son selvas subperennifolias, donde un porcentaje importante de la vegetación pierde la hoja, pero la mayoría la conserva todo el año.